如果阴谋论者的假设是正确的——根据民意调查，在肯尼迪的案子中，世界上大部分人都是这么看的——那就可以假设，那天在附近肯定还有另外一个枪手，只是没有被人发现罢了。
碰巧，那天确实有报道称，有形迹可疑的人在案发现场逗留。
尽管其中一些回忆可能存在偏执、妄想（总统车队经过，肯定会引来形形色色看热闹的人），弗兰克·斯特吉斯宣称，他们在水门事件中闯入建筑物的目的是窃取驻扎迪利广场美国特工的照片，而且因此而被定罪，而关于那三个神秘“流浪汉”
（尽管胡子刮得干干净净，但不足以令人相信的人）的报道，则更使人们对于整个事件有了更多的猜想。
潜在的罪犯
虽然E.霍华德·亨特本人否认当时在场（后来的一些问询也支持这种说法），人们普遍认为，其中一个“流浪汉”
就是他，时任中央情报局官员，他的名字已与肯尼迪枪杀案多有联系。
不管那天他是否在达拉斯，他一定就是在水门事件中行窃却未能得逞的那个人（他被关了33个月的监禁之后被杰拉尔德·福特总统和尼克松赦免）。
2007年亨特去世前不久，他儿子声称，他的父亲私下里告诉他，他参与了策划刺杀肯尼迪的事件。
这不可避免地引发猜测，肯尼迪的死也许不是由古巴流亡者、或菲德尔·卡斯特罗、或黑手党、或苏联、或一个财团的银行家、或不满的以色列人策划的，阴谋论界一直坚信，林登·B.约翰逊也与此事有很大的牵连，脱不了干系。
从这一点来看，刺杀肯尼迪的本质是一场政变。
综观种种可能，有一点是肯定的，那就是，肯尼迪的处事方法（以及多样的生活方式）与传统总统的风格迥然不同，他和弟弟罗伯特·F.
肯尼迪努力限制法律（如果只是）机构（比如美国联邦储备理事会），以及非法律机构（如黑手党之类的）的权力，这些无疑都激怒了那些不好惹的角色。
与此同时，古巴流亡者也因为企图在1961年的猪湾事件中，从卡斯特罗手中夺回政权遭致失败而心怀怨恨，他们无疑也乐意终结肯尼迪的任命。
还有一种说法将肯尼迪详尽地公布UFO证据的做法，作为有人对他使用各种阴谋的黑色行动，迫使他离任的又一理由（见第七章）。
其中显然有受益于肯尼迪之死的派系的参与，但最可能的矛头似乎指向美国情报部门，它已经成为安排暗杀的幕后帮凶，不管是谁，只要给钱就行。
肯尼迪阴谋论有如此多的说法——有些是逻辑清晰且相互联系，另一些则相互矛盾和虚构——随着数十年时间的逝去，已经不可能完全把最有可能暴露事实真相的关键线索提取出来。
这只有等到最后公布机密文件档案的那一天了，因为事实的真相不大可能那么容易显现出来。
毁灭证据和证人
有人声称肯尼迪遇刺的重要证据从一开始就被篡改。
泽普鲁德拍摄的至关重要的胶片，虽然很清晰，不过它本身也不完全可靠。
有几个很有影响的观点认为，公开的版本已经被删改，关键的细节可能在某些地方已经被感光乳剂划损。
已故的且具影响力的阴谋理论家威廉·库珀称，其中一些隐藏的细节显示，当其他的子弹射击过来的时候，轿车司机威廉·格里尔从前排座位快速转身开了致命的一枪。
其他影像证据，比如尸检照片显示了总统受伤的大脑，也被人们质疑，他们认为，发布的图片显示的不是真正的伤口，反而成了掩盖存在另外枪手的证据了。
一个有用的证人可能会透露更多，当然这证人不可能是李·哈维·奥斯瓦尔德，他在被捕后的两天即被枪杀；还有愤怒的夜总会老板，杰克·鲁比，可能代表平民进行报复。
有人说肯尼迪那么容易被暗算，是因为枪击那天缺乏安保人员，之后，在奥斯瓦尔德从警察总部被带出送往县监狱时，安全保卫同样懈怠，一群新闻记者和摄影记者弄得现场混乱不堪，而这个明显的疏忽可以让鲁比轻松地挤入人群，向奥斯瓦尔德近距离射击。
鲁比与奥斯瓦尔德确有私人恩怨，并且知道肯尼迪遇刺阴谋的内幕。
值得注意的是，露丝·雪瑞儿公开承认自己吸毒，并当过脱衣舞女，11月22日，她提前告诉警方，她知道谋杀肯尼迪的计划。
两次枪击刺杀案发生后，她还声称，鲁比和奥斯瓦尔德曾保持着同性恋的关系。
怀疑者开始对她的言词不屑一顾，但她两年后“突然”
意外地死在了车轮之下，这让他们对此进行反思。
鲁比很快被宣判犯有谋杀罪，在第二次即将上诉审判时，他吐露出一些重要的细节，显然他知道的远远超过他在第一次审判时被允许说的内容。
不过，还没有等他有机会上诉，他就于1966年底死于癌症。
1965年，鲁比曾在一次电视新闻发布会上说：一切能说清到底发生了什么证据从来没有浮出水面。
世界将永远不会知道所发生的真相和我的动机。
处于这个位置的我，绝不会让真正的事实光明正大地公布于众。
当一个记者接着问道：“杰克，你背后都是些地位显赫的人吗？”
鲁比做出的回应为：“是的。”
鲁比自己也成为一个阴谋论家，他怀疑癌细胞是监狱医生故意注射到他的身体里的。
后来，鲁比对精神科医生维尔纳·提特说刺杀肯尼迪是“推翻政府”
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