后来建炎四年，秦桧南归，入见高宗赵构，主张和议，得拜礼部尚书。绍兴元年参知政事，随后拜为宰相。次年，遭吕颐浩排挤，因专主和议、植党专权等行径而被罢为观文殿学士、提举江州太平观。绍兴七年，授枢密使。次年，复为宰相。执政期间，倾陷张浚、赵鼎，独揽相权。
他怂恿高宗令北伐大军班师回朝，收大将兵权，陷害岳飞，打击抗战派，促成绍兴和议，除了规定南宋对金称臣、纳贡、割地外，还不得以无罪去首相，秦桧得以长期当权，加太师，进封魏国公。绍兴二十五年，秦桧病亡，追赠申王，谥号忠献。开禧二年，宋宁宗追夺其王爵，改谥谬丑。嘉定元年，史弥远执政后又恢复其王爵和谥号。宝佑二年，宋理宗又将秦桧改谥缪狠，这个混蛋奸臣才彻底被钉在了耻辱柱上。
而在《说岳全传》之中，秦桧不是凡人，但却不是天上来的神仙星宿，而是黄河中的铁背虬龙再转世。
在东汉许真君，也就是许贯忠老祖宗，四大天师之一的许逊斩蛟之时，蛟精变成秀才入赘到了贾刺史家。许真君一路追杀，擒拿住蛟精，剑斩他与贾氏三个儿子中的两个，只有最小的一个蛟精逃到了黄河边，修行八百多年后得道，自称“铁背虬龙”。
而岳飞的前世金翅大鹏前往东土投胎时，正路过黄河边，此时正逢铁背虬龙带着虾兵蟹将玩耍，大鹏凶恶，看见妖物直接就飞了下去，一下啄瞎了铁背虬龙的左眼。
铁背虬龙无端被啄瞎一只眼，又怎么能咽得下这口气，在打听到大鹏托生到岳家庄时，铁背虬龙就发大水淹没了岳家庄，只有岳飞母子得陈抟老祖相助才逃了一难。而铁背虬龙却是因犯了天条，上剐龙台被屠龙力士斩首，他一点魂灵不灭也是托生为秦桧。
秦桧长大后先考取新科状元，从北国回来又任礼部尚书再为相。后来，金兀术因为屡屡败给岳飞，责斥秦桧背了先前之盟。因此，秦桧设计召回岳飞将他关在了大理寺中，又设计将他害死于风波亭上。
当然，秦桧自然也没能善终，自岳飞死后，他也重病疼痛而死，而且还在地狱遍历各种苦楚，胡梦蝶梦游地府的时候，就清晰的看到了他被折磨的情况。
宋江和秦桧谈论了一下，简单的了解到了他们这支使团的任务和情况。
他们这次出使的目的地是在东南亚爪哇国，爪哇国，又作爪洼国、叶调、诃陵、阇婆、呵罗单、耶婆提，古代东南亚古国，其境主要在今印度尼西亚爪哇岛一带。
唐朝时，爪哇国一度为佛教国家，宋朝